地球化学研究数据库是在整合中国科学院广州地球化学研究所多年科研成果的基础上，以公开发表的基础地球化学数据为补充而建立起来的一个科学的、标准的、兼顾基础和学科前沿的应用型数据库。该数据库主要从地球化学研究的对象出发进行建立，包括常量元素地球化学数据、微量元素地球化学数据、稀土元素地球化学数据、干酪根地球化学数据、煤、石油、天然气等数据,同时还包括了各类型地球化学空间信息数据。地球化学研究数据库同时还把环境数据纳入进来，主要建立持久性有机污染数据库POPs，以地球化学和社会环境的视角建立起珠三角地区持久性有机污染数据信息，为地球化学的后续发展和研究提供重要的基础数据支持。

以岩石和矿石等地质样品的化学组成数据为主要数据源，建立岩石和矿石的13-15项氧化物含量数据库，并包含岩石样品的描述性辅助数据。

以岩石和矿石等地质样品的化学组成数据为主要数据源，建立岩石和矿石的13-15项微量元素含量数据库，并包含岩石样品的描述性辅助数据。

以岩石和矿石等地质样品的稀土组成数据为主要数据源，建立岩石和矿石的17项稀土元素含量数据库，并包含岩石样品的描述性辅助数据。

以岩石和矿石等地质样品的稳定同位素组成为主要数据，包含碳氢氧等同位素的组成，并给以岩石样品的描述性辅助数据的一个专业同位素数据库。

烃源岩地球化学数据库是一个包括烃源岩基本特征数据、烃源岩有机地球化学数据和热解数据的重要的地球化学数据库之一。

天然气地球化学数据是一个包括天然气化学组成的专业数据库，同时包括了单体碳、氢同位素以及稀有气体同位素数据，同时还包括天然气样品描述的辅助数据。

石油地球化学数据库包括中国石油地质基本特征数据，物理特征数据和石油化学组分数据以及石油生物标志数据等信息，是关于能源的一个重要的基础数据库。

有机岩石学数据库包含干酪根，煤等物质的基本特征数据，同时也包含干酪根，煤元素组成数据和干酪根热解数据。

持久性有机污染数据库是一个重要的环境污染地球化学数据库，包括了水体，大气，沉积物，土壤等介质中的多环芳烃，多氯联苯等3-4类POPs的污染数据以及环境样品的描述性辅助数据。